Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA9Q9UGM1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms