Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL13Q9P2N7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms