Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FANCLQ9NW38 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCLQ9NW38 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms