Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms