Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms