Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOL6Q9BWW8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms