Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms