Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNNM3Q8NE01 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNNM3Q8NE01 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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