Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TMCO5AQ8N6Q1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMCO5AQ8N6Q1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMCO5AQ8N6Q1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMCO5AQ8N6Q1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMCO5AQ8N6Q1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMCO5AQ8N6Q1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TMCO5AQ8N6Q1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TMCO5AQ8N6Q1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMCO5AQ8N6Q1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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