Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms