Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM20Q8N5G0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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