Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HAPLN4Q86UW8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms