Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCD3Q6STE5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms