Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms