Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms