Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms