Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms