Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms