Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PCID2Q5JVF3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms