Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI3KQ59H18 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms