Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P5Q59GN2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms