Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0Z9

MCMDC2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMDC2Q4G0Z9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCMDC2Q4G0Z9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms