Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP27-1Q3LI81 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms