Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RRN3P1Q2M238 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RRN3P1Q2M238 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RRN3P1Q2M238 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RRN3P1Q2M238 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RRN3P1Q2M238 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RRN3P1Q2M238 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RRN3P1Q2M238 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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