Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX7Q2KHR2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms