Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM187BQ17R55 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM187BQ17R55 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms