Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms