Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNHIT3Q15649 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms