Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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