Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms