Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLINT1Q14677 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLINT1Q14677 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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