Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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