Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms