Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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