Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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