Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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