Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms