Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms