Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
COL16A1Q07092 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms