Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms