Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms