Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms