Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOSBP53539 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOSBP53539 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms