Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms