Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAP1GDS1P52306 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAP1GDS1P52306 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms