Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E1P51965 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms