Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA2P47869 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms