Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms