Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZEB1P37275 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZEB1P37275 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms