Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms